Poleg zaviranja rasti in razmnoževanja mikroorganizmov ima vakuumska deoksigenacija še eno pomembno funkcijo, saj preprečuje oksidacijo hrane. Ker mastna hrana vsebuje veliko nenasičenih maščobnih kislin, le-ta zaradi delovanja kisika oksidira, zaradi česar je hrana slabega okusa in pokvarjena. Poleg tega oksidacija povzroči tudi izgubo vitamina A in vitamina C, na nestabilne snovi v barvilih za živila pa vpliva kisik, da potemni barvo. Zato lahko deoksigenacija učinkovito prepreči kvarjenje hrane in ohrani njeno barvo, aromo, okus in hranilno vrednost.